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Knitr学习笔记(一):R语言自动化报告格式——knitr

来源:经管之家 | 2015-08-17 | 发布:经管之家

       

       一、背景

       在R的世界里,凡是提到自动化报告,很多人就会想到Sweave,它已经诞生十几年了。它的主要设计思想来自于文学化编程(Literate Programming),这是Knuth大神提出来的一种编程范式,它与传统的结构化编程不同。

       knitr (发音为:nit-ter)是由纯文本 (就像你正在阅读的) 和R代码交织在一起的文档文件. 用作者的话来说就是:“knitr 是一头灵活,快速的大象!” 你可能正在想……这玩意和数据挖掘有什么必然的关系呢? 使用knitr去学习数据挖掘乍看起来是一个奇怪的搭配,但确实是一条很好的学习途径。 

       有三个方面的原因: 这是学习R完美的途径。不一定每个人都是这样做的,但是knitr能让你运用学到的东西以及建立一个可重复生成报告的文件。 Knitr和RStudio集成是快速生成报告的最佳组合。简单地说,报告中有文字也有代码,Knitr就是通过markdown的语法在报告中该显示代码的地方显示代码,该显示运行结果(比如图表)的地方显示运行结果,这样整个报告文档就可以直接运行再次生成报告,而不需要把代码单独复制到控制台中执行,然后再把执行结果添加到文档中。 

       1、文学化编程也是编程

       文学化编程(Literate Programming)是整个设计的核心思想,但过去的模式局限在“代码+文档”的简单模型上,knitr使得一份文档变得可编程。

       

       2、Markdown 是什么,如何写Markdown

       Markdown 是一种轻量级标记语言。类似HTML,但是比html简单的多,我在文件夹中放了一个markdown的语法说明。 大家具体可以用一段时间学会。我们这里知道这么几点就可以了。标题,一个#后面跟一个空格代表一级标题,2个## 后面跟一个空格代表二级标题。

  • how are you 斜体

  • how are you 加粗

       二、创建knitr文档

       不要停下来! 通过以下5步,你就可以创建自己的第一个knitr文档:

  • 打开 RStudio, 点击File > New File > R Markdown…创建一个新的R Markdown 文件

  • 为这个文件起一个有意义的名字。

  • 点击OK.

  • 删除第二个"---"之后出现的文字

  • 点击Knit HTML.

  • 你的R Markdown代码应该像下面这样:

        

       title: "Your Title"

       output: html_document

       在“knitting”你的文件后, 你应该会在查看器窗格看到下面的文字:

       恭喜你! 你已经成功创建了第一个knitr文件!

       三、相关代码——文本输出[]

       在文本输出方面,knitr包支持以下功能:

  •  代码高亮(highlight=TRUE),增强可读性,有无数的高亮主题可选,仅适用于LaTeX和HTML输出,MD文档在转为HTML文档之后可以用专门的JavaScript库去高亮代码
  • 代码重排(tidy=TRUE),对那些不注意代码格式的人来说很有用,再乱的代码,到了这里也会变得相对整齐,本功能由formatR包支持
  • 执行或不执行代码(eval=TRUE/FALSE),不执行的代码段将被跳过,原样输出源代码 
  • 显示/隐藏源代码(echo=TRUE/FALSE),甚至精确控制显示哪几段代码(echo取数值)
  • 显示/隐藏普通文本输出或将文本输出以原样形式输出(results='markup', 'hide', 'asis')
  • 显示/隐藏警告文本(warning=TRUE/FALSE)、错误消息(error)和普通消息(message)
  • 显示/隐藏整个代码段的输出(include=TRUE/FALSE),比如我们可能想运行代码,但不把结果写入输出中

       (作者自己整理,原创,详情请查看附件)
      

文章为作者独立观点,不代表经管之家立场
本文已经过优化显示,查看原文请点击以下链接:
查看原文:http://tougao.jg.com.cn/article/3678.html

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